1937年7月7日在盧溝橋事變爆發前，時任民生實業公司總經理、四川省建設廳長的盧作孚，正協助政府完成川康整軍，并代表四川省政府主席劉湘，將川康整軍會議的圓滿成果及建設新四川意見，呈報給蔣介石，甚得蔣介石的贊賞，請求劉湘，允將盧作孚調至中央服務，并先派盧作孚參加政府組成的赴歐洲考察團，以開拓其視野。適逢盧母逝世及中日戰爭爆發，盧作孚遂中止赴歐考察行程，認為國家對外戰爭開始了，民生公司的任務也就開始了，遂帶領民生實業公司積極投入抗戰行列。

　　1937年8月4日北平失陷，日軍由平漢、津浦兩鐵路線南侵，國民政府為進行全盤對日抗戰考慮，決定于8月13日在上海發動會戰，以期爭取時間，將京滬杭地區最富有經濟價值的人力、物力，沿長江內撤大后方，和日本進行長期持久戰。由于上海戰事即將爆發，8月11日軍政部、海軍部聯合召開緊急會議，研究上海南京間布防問題，決定于12日晨7時，集中所有預備船只，開往江陰，沉船阻塞長江航道，以防日艦長驅直入，爭取政府與人民物資沿長江后撤的時間。同日，交通部密令各航政局及輪船公司，速將航行沿海及長江下游國輪駛入長江或停泊香港等安全地帶，以免資敵。盧作孚配合抗日國策，令民生公司航行上海輪船，不等卸貨，即刻原船返航重慶。

　　1937年8月12日，海軍部長陳紹寬親率艦隊開始于江陰城下游長山港鵝鼻嘴下端長江江面最窄處下令沉船阻塞長江航道，構筑第一道長江封鎖線。淞滬會戰爆發后，中國政府陸續調集75萬軍隊與日軍激戰。面對全面抗日戰爭的情勢，國民政府于8月11日特命蔣介石為“陸海空軍大元帥，組織陸海空軍大本營，指揮全面抗日戰爭”。盧作孚一面奉派出任大本營第二部副部長，擔任擬訂抗戰總動員計劃；另一方面趕回四川，促川軍出川參加抗戰，9月1日川軍14師和兩個獨立旅分東、西兩路開赴京滬及平漢路作戰，其中東路4個師及兩個獨立旅由盧作孚集中民生實業公司所有輪船于兩星期內迅速由重慶、萬縣趕運至宜昌，參加南京保衛戰。10月18日再趕運川軍出宜昌轉漢口赴南京及平漢路抗敵。一方面，盧作孚已感受到中國長期抗戰的決心，即刻號召民生實業公司首先起來參加抗戰，盧作孚認為國家對外戰爭開始了，民生實業公司的任務也就開始了。于是民生實業公司在盧作孚率領下，動員全體職工救國捐款，進而調派全部船只，不畏日機轟炸，英勇地投入抗戰運輸。

　　面對淞滬會戰爆發及長江江陰航道的封鎖，從航運的觀點而言，盧作孚了解到政府勢需內撤京滬地區的政府機構、學校、工廠器材和人民至大后方，建立抗戰基地，才得以維持長期持久抗戰的國力。此時盧作孚為應對即將來臨的京滬地區政府人民物資沿長江航道的大撤退，集中民生實業公司長江中下游船只于鎮江、南京、蕪湖等地，緊急部署。

　　首先，民生公司集中鎮江船只主要接運由上海、蘇州、無錫、常州后撤的民間工廠機械、貨品。在8月中旬，盧作孚即多次與負責上海地區工廠內遷的上海工廠遷移監督委員會主任委員林繼庸(8月11日接任)，商洽內遷工廠入川設廠事宜。而且隨時派人去調查接洽，有貨可裝，即派船去接運。9月1日盧作孚設民生實業公司鎮江臨時辦事處統一指揮。盧作孚開設鎮江臨時辦事處的目的，在于長江江陰封鎖后，長江下行輪船止于鎮江，且鎮江已成為上海地區人民物資利用長江水道后撤的運輸樞紐，因而鎮江臨時辦事處即成民生實業公司與南京國民政府、上海地區后撤工廠商辦配貨、裝載、轉運的辦事機構。9月2日民生實業公司民泰輪首航鎮江。當時上海地區民間工廠的后撤系先以木船循蘇州河運蘇州后，雇用小火輪拖原船走江南運河至鎮江，再換江輪走長江直駛漢口或重慶。盧作孚先后派民生實業公司的民泰、民憲、民族、民勤等輪參與上海及附近地區工廠內遷。上海地區工廠自8月22日起，第一批順昌機械廠等4家工廠，雇用21只木船自上海開始遷移，至12月初鎮江撤退止(12月8日日軍天谷支隊侵占鎮江)，共遷出民間工廠146家，成百萬噸機械器材，技術工人2500余人。其中鎮江臨時辦事處自9月1日設立，至11月20日因日軍向鎮江進逼而撤離的2個月又20天時間，辦理運送政府公物及民間工廠器材到漢口或重慶，共5，149噸，包括9月份運1，692噸，10月份運2，063噸，11月份運1，393噸。

　　其次，民生公司集中南京船只主要撤退國民政府機關人員和公物，學校師生、儀器、圖書等。為了順利完成國民政府機關人員和公物撤退任務，民生實業公司特于1937年10月23日專門召開轉運西上客人服務工作及宣傳辦法會議，研究轉運國民政府官員600人及留宜昌旅客5，000人的服務宣傳辦法。會后通函公司航行各輪，在抗戰非常時期，全體船員動員起來，努力實現公司宗旨，表現服務精神。1937年11月國民政府各機關人員器材、公文檔案開始由南京后撤武漢，盧作孚亦派民生實業公司民政、民貴、民元、民風等輪船參加撤運。其中11月16日國民政府決定遷都重慶，當日國民政府主席林森率部由南京乘永綏軍艦后撤，于11月21日抵宜昌，23日林森率文官、參軍、主計處主管改乘民生實業公司民風輪入川，其余人員和物資亦分乘民生實業公司民政、民貴等輪隨后跟進，于26日抵重慶。使得國民政府能于12月1日開始在重慶辦公。在撤運時，民元輪上客艙均由幾個政府部會分配應用，于房艙門上用粉筆寫上使用部門名稱，民元輪船工打趣說:民元輪成為國民政府啦！1937年10－11月間，民生實業公司利用其南京辦事處所屬澄平碼頭，從南京搶運到漢口的物資，共6，491噸，包括10月公物2，957噸，11月公物2，877噸，另搭商貨657噸。

　　另外，民生公司還集中蕪湖船只主要運送兵工署兵工器材。1937年9月間盧作孚在南京首先和金陵兵工廠商談由民生實業公司，搶運金陵兵工廠槍彈廠2，000噸器材運四川事宜，10月18日雙方簽訂合約，由蕪湖裝船運重慶，限2個月完成。運價全程每噸75.6元，分起運時、過漢口時、抵重慶時，三次平均付清；兵工廠員工、家屬搭船半價優待。盧作孚調民生實業公司可容500噸之民本、民風、民元、民權等4輪至蕪湖，于限期內提前完成任務，取得了兵工署的信任，為其后承運大批兵工器材后撤四川打下良好基礎。

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　　據資料顯示，抗戰爆發后，盧作孚首先號召民生實業公司員工為長期抗戰捐款救國，而且規定不可如1931年東北“九一八”事變和1932年上海“一·二八”事變時公司職員每月捐一天薪金的前例。公司上層規定出最低限度，即每人依薪水多寡，一次捐月薪10％～30％。具體細節是:所得50元以下捐月薪10％；50元至100元捐月薪15％；100元至150元捐月薪20％；150元至200元捐月薪百分之25％；200元以上者捐月薪30％，以購救國公債，發揮國家興亡，匹夫有責的本分。