日本官房長官菅義偉在2月15日的記者會上就朝鮮宣布中止綁架問題再調查工作并解散特別調查委員會一事表示：“感到極其遺憾，無法接受此事。”他還就承諾對綁架問題等進行全面調查的2014年“斯德哥爾摩協議”明確表示，“日本無意撕毀協議”。

日本共同社2月15日報道稱，朝方譴責日本加強單邊制裁相當于撕毀協議。菅義偉強調綁架問題“對安倍政府來說是極為重要的課題”，并解釋稱日本政府并未接到朝鮮的官方聯絡。

日本官房副長官萩生田光一在14日的富士電視臺節目上就此事表示：“準備繼續談判，將不關上大門，切實維持溝通的渠道?！?/p>

他同時表示:“將與美韓合作，通過國際社會的施壓推動事情朝好的方向發展?！彼€表示，在日本決定加強制裁時就“預想到(朝方)會有所反應，我方并不慌亂”。