要讓科研經費用到刀刃上，需落實科研自主權，并建立用好自主權的一系列制度。制度的核心，是約束行政權，實行學術本位管理與學術同行評價。

近日的國務院常務會議，確定完善中央財政科研項目資金管理的措施，包括增加間接費用比重，用于人員激勵的績效支出占直接費用扣除設備購置費的比例，最高可從原來的5%提高到20%；中央高校、科研院所可根據工作需要，合理研究制定差旅費管理辦法，確定業務性會議規模和開支標準等。

近年來，對于我國的科研經費管理，科研人員多有抱怨，媒體也曾報道科研經費使用的諸多亂象，可以說，依靠行政部門的管理，非但沒有提高科研經費的使用效率，還挫傷了科研人員的積極性。放權給科研人員，增加科研人員的科研自主權和科研經費支配權，是激發科研活力的重要改革措施。但輿論也擔心，這會不會讓科研經費變成“唐僧肉”，而要消除這種擔憂，就需要在放權給科研人員后，進一步完善科研管理和評價制度建設。

首先，對科研人員，要改變目前以行政為主導的評價，代之以學術共同體評價。以學術原則和學術標準評價科研人員的學術能力和學術貢獻，淡化科研的行政化和功利化，重樹學術尊嚴，讓科研人員安心科研，有科研創新的理想和追求。

其次，對科研人員實行年薪制。當前的基本工資+津貼+獎金的薪酬制度，迫使科研人員通過申請課題經費來解決津貼和獎金問題。國家提高科研項目人員費比例，不是提高傳統的“科研提成”——科研經費一到手，就按一定比例被提成作為科研人員的收入，而是重視科研的人力投入。在歐美國家，科研經費用于人員的比例很高，但這不是用于提高項目負責人的待遇，而是用于聘請訪問學者、資助研究生、博士生，項目負責人拿額定的薪酬，如果學校支付教授9個月年薪，教授可在項目中支取3個月薪酬，但總額不得超過額定年薪。這至少避免了兩個問題：其一，科研還沒開展，科研經費已進入項目負責人腰包；其二，參與經費充足的重大課題，教授收入就高，而課題、經費少的學科，教授就“貧窮”沒地位。

此外，科研人員根據科研需要自主支付差旅費，是尊重科研規律，但取消了不合理的前置審批、報銷規定，不意味著科研人員的開支可以隨心所欲。要讓科研經費不被揮霍、濫用，需要詳細公開科研項目的財務開支，并接受師生、同行和社會公眾監督。

到2020年，我國研發經費占GDP的比例將達到2.5%，要讓科研經費用到刀刃上，需落實科研自主權，并建立用好自主權的一系列制度。概而言之，對于大學來說，就是建立現代大學制度；對于科研機構來說，就是建立現代科研院所制度。制度的核心，都是約束行政權，實行學術本位管理與學術同行評價，同時，財務信息全部公開透明。