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韓國學者再質疑韓春雨:該技術只能“沉默”基因

2017年01月22日 22:30 | 來源:澎湃新聞網
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韓春雨的NgAgo技術深陷可重復性泥潭,韓國學者發表文章稱,NgAgo能在體外切割RNA(核糖核酸),而非如韓春雨論文所稱在哺乳細胞內切割DNA(脫氧核糖核酸)。

2016年11月,在《自然-生物技術》上,韓國基礎科學研究所基因編輯中心金鎮洙(Jin-Soo Kim)團隊與另兩個團隊一起,發表了一篇評論通信文章,表示利用河北科技大學韓春雨課題組的NgAgo技術未能檢測到DNA引導的基因組編輯,質疑了韓春雨NgAgo實驗的可重復性。

近2個月后,1月20日,在生命科學預印本網站BioRxiv上,金鎮洙發表了另一篇關于NgAgo技術的論文。BioRxiv由非營利機構美國冷泉港實驗室創辦,旨在加速研究傳播,在科學家的論文正式開始同行評議前,使其獲得論文反饋的機會。

在論文中,金鎮洙沒有否定兩個月前那篇評論通信文章的結論,再次在文章中提到了無法重復實驗。但他發現了關于NgAgo另一個特性——在體外,NgAgo能作為一種DNA引導的核酸內切酶切割RNA。

這意味著NgAgo或許可以作為“RNA干擾”的一種工具發揮作用。RNA干擾的一種形式是基因沉默,也就是讓特定基因不表達,這可以用在疾病治療上,通過讓致病基因“沉默”來達到治療效果。

據《自然》雜志1月20日的報道,金鎮洙透露最近已經申請了一項關于使用NgAgo進行基因沉默的專利。

值得注意的是,韓春雨課題組于2016年5月在《自然-生物技術》發表關于NgAgo技術的論文,報告的是在哺乳細胞系統中,以DNA為介導,NgAgo能對DNA進行高效地切割編輯。這和金鎮洙最新報告的NgAgo特性并不一致——一個切割RNA,一個切割DNA,對應不同概念。

此前,2016年11月,南通大學和復旦大學團隊發表在《細胞研究(Cell Research)》上的一項研究和金鎮洙的最新結論相呼應。

那篇發表在《細胞研究》上的論文顯示,研究團隊在斑馬魚的細胞中使用NgAgo技術后,斑馬魚的眼睛發育出現了缺陷,疑似發生了基因編輯。但是進行測序后才發現,基因組層面上或者說DNA層面上,沒發生任何編輯。進一步,他們檢測發現,只是mRNA表達量上發生了改變。這意味著引起發育缺陷的原因是基因敲低,而不是基因編輯。

澎湃新聞此前也介紹過基因敲低和基因編輯的差別。簡單而言,基因敲低是對RNA進行干擾,影響部分基因表達,基因編輯則是對DNA進行干擾,完全影響基因表達。兩者在效果上的差別可以形象理解為錘子和剪刀之別。

從生命體的運轉流程說起。DNA是負責引導生物發育與生命機能運作的“司令”,但具體的生物功能都由蛋白質來執行。所以,DNA需要先轉錄成為RNA,再通過RNA翻譯成蛋白質。這個過程稱為基因表達,其中,RNA充當了中介的角色。

DNA與RNA之間的關系。 微信公眾號“賽先生” 圖

如果通過人為的方式,對RNA這個中介進行干擾,使得基因表達降低,只能完成一小部分的基因表達,讓蛋白質無法正常工作,我們就將這一現象稱為“基因敲低”。如果是對DNA這個發號“司令”進行變動,使得基因的序列發生變化,那是更高級別的干預,會完全改變基因表達,我們稱為“基因編輯”。

此外,澎湃新聞了解到,NgAgo蛋白酶是Ago家族成員之一,而Ago能降解、調解RNA的研究結論并不新鮮,只是有的Ago通過RNA引導,有的通過DNA引導。金鎮洙的最新研究是進一步揭示了NgAgo如何干預RNA的機制。

值得一提的是,越來越多的跡象都在指向NgAgo技術或許只是在基因沉默上有潛力,而非基因編輯。

在《自然》雜志1月20日的報道中,韓春雨表示,諾維信有證據表明NgAgo能進行基因調控,并透露諾維信認可這一點。但《自然》雜志同時指出,基因調控既可以通過基因編輯也可以通過基因沉默來實現。韓春雨對《自然》表示,透露更多涉及專利的信息之前,他需要和律師商談。

1月19日的兩則動態讓韓春雨NgAgo技術的可重復性爭議有了新進展。

這一天中午,《自然-生物技術》表示獲得了與NgAgo系統可重復性相關的新數據,需要進行調查研究。韓春雨向澎湃新聞表示這是他們團隊提交的,并否認了是原始數據。

緊接著,當日下午,河北科技大學官網貼出了“河北科技大學基因編輯技術研究中心與諾維信公司簽署合作協議”的文章。次日,諾維信公司發表聲明承認在NgAgo上達成合作。但河北科技大學和諾維信公司都在重復性問題上避而不提,只是分別表示NgAgo在“真菌表達系統”和“生產酶的微生物表達系統”上有潛力。

澳大利亞大學約翰?克汀醫學研究中心的基因學家加埃唐?布爾焦(Gaetan Burgio)是最早公開質疑NgAgo實驗可重復性的生物學家之一,他在小鼠受精卵中進行了實驗,但未看到有基因編輯跡象。

布爾焦在接受《自然》采訪時提到,諾維信有一項用于基因沉默的RNA干擾技術,布爾焦推測諾維信與河北科技大學基因編輯技術研究中心可能是找到了一種更有效的方法來沉默基因。

對于諾維信和河北科技大學基因編輯技術研究中心的合作,北京大學生命科學學院教授魏文勝對《自然》表示:“這不能改變什么。韓春雨(在論文中)說NgAgo能在哺乳細胞系統中高效地進行基因編輯。那就證明這個!”


編輯:薛曉鈺

關鍵詞:韓國 韓春雨 技術

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