顏色：南紅瑪瑙的顏色十分自然，色澤鮮潤具活性感、純正、厚重、協調，而燒色瑪瑙和紅色玻璃的顏色往往十分不自然，而且往往艷麗輕浮。此外，燒色瑪瑙的顏色還會偏向紅棕色。

紋理：南紅瑪瑙的紋路比較清晰 ，在紋路中間也沒有粉末狀或者是一些雜色，但是假的南紅瑪瑙就會在裂紋處出現一些火燒的痕跡，這其實還是比較容易看出來的。另外，南紅瑪瑙在時間的推移之下會產生風化的情況，從而產生月牙狀的風化紋。但是假的就不會有。

透明度：南紅瑪瑙的透明度并不高，大多是不透明的，有的能看見自然水線或“云彩”或“絲絮”狀結構，是一種膠狀的形態，就算是無色的南紅瑪瑙也不會很透明，會有著一層朦朧感。而燒色瑪瑙和合成玻璃的透明度都十分優秀，有的甚至完全透明，十分不自然。

材質：南紅瑪瑙的結果一般較為緊密、結實，多數非酸堿影響的瑪瑙利茬可在玻璃板上劃出劃痕來，而有些沖壓而成的仿冒南紅質地十分松散，材質易碎且輕。

溫度：天然的南紅瑪瑙有涼感，而人工合成的瑪瑙隨外界溫度的變化而變化。