完善主產區利益補償機制存在著利益協調難、標準核算難、補償界定難等問題，已經建立的省際生態利益補償機制，可為省際橫向利益補償機制建設作為參考和借鑒。

凈調入/調出補償法。由國家糧食和物資儲備局，按照各省糧食產銷平衡表，測算主產區和主銷區糧食“凈調入/調出量”，并以此為依據按糧食生產成本測算補償額。

機會成本法。在主產區、主銷區、產銷平衡區確定必保的糧食面積和產量基礎上，根據主銷區實際，以省際為單位建立糧食生產機會成本補償機制，由主銷區與主產區建立產銷協作關系。

保險替代法。目前，全國普遍建立了三大主糧完全成本保險和種植收入保險，保險補貼由出險地所在省份財政安排。可采取由主銷區省級財政與主產區省級財政對接方式，對主產區農業保險補貼給予直接替換。

投資產能折抵法。主銷區可通過在主產區投資建設高標準農田、綠色糧食倉儲設施或者開展利益分成的產銷合作等，按照投資額度、增產潛力、收益分配等折算成一定比例的產能，進行金額抵扣。

指標交易補償法。將主產區、主銷區、產銷平衡區糧食調入/調出納入計劃管理，實行市場化運營，構建省際糧食調進調出指標交易的市場化平臺，由各省自發確定補償標準。

為此建議：

堅持試點先行，選取1-2個主銷區開展試點，先口糧再擴大到谷物。完善產銷合作，鼓勵主銷區與主產區共建糧食生產基地、倉儲設施、加工園區和營銷網絡，支持主產區發展糧食加工業，助推主產區從“賣原糧”向“賣產品”轉型。主產區、主銷區和產銷平衡區都要保耕地、保面積、保產量，著重提高主銷區糧食自給率，穩住產銷平衡區，彈性設定各區糧食自給底線。完善制度體系，推動補償機制措施制度化，為構建更高層次、更高質量、更有效率、更可持續的國家糧食安全保障體系提供制度保障。