太醫院13科 接近現代醫院科室設置

明朝太醫院分為13科，即大方脈、婦人、傷寒、小方脈、針灸、口齒、咽喉、眼、瘡瘍、接骨、盎鏃、祝由、按摩，同元代13科相比，風科改為傷寒，金瘡分為金鏃和瘡瘍兩科，雜科改為按摩，取消了禁科，較前代更適合臨床需要。

明朝太醫院的分科與現代醫院科室相比，可以說已經很接近。大方脈相當于現代的內科；婦人相當于婦科；傷寒相當于傳染科；小方脈相當于兒科；針灸和按摩與現代名稱相同；口齒、咽喉、眼分別相當于現代的口腔、喉、眼科，瘡瘍、接骨、盎鏃則相當于部分現代大外科，分別是普通外科、骨科、戰傷；祝由包括中草藥在內的，借符咒禁禳來治療疾病的一種方法，具有濃重的迷信色彩。

太醫院每科由一到數名御醫或吏目掌管，下屬醫士和醫生，各科御醫或吏目人數為：大方脈5人，傷寒4人，小方脈2人，婦人2人，口齒、咽喉、瘡瘍、正骨、痘疹、眼科、針灸各1人，下屬醫士醫生70余名。

御藥局和御藥房 皇帝專屬“藥劑科”

明朝的醫療機構十分齊全，以太醫院為總協調，還設有專司用藥的藥局，有專門為宮廷服務的御藥局等，還有慈善機構惠民藥局。

吳元年（1364年），朱元璋設尚藥局。洪武六年（1373年），改尚藥局為御藥局。御藥局主要任務是監制御用藥餌，兼管收儲各地進貢的名貴藥材。

同年，又設御藥房。御藥房的一個重要職責是根據藥方監督御藥煎制。在御藥制作時，要有太醫院院官和內臣一同監視，做好后每劑藥都分成兩服，其中一服先要由御醫、院判、內臣三人嘗過之后，沒有問題，才將另一服進獻給生病的皇上，這一系列的診治、制藥過程，都要在專門的醫簿上做詳細的記錄，這些記錄由所有參與診治及制藥、嘗藥過程的醫官、御醫、內臣簽名后，加蓋“中書省印合縫”，以備查考。如果皇上服用后，治療效果不佳，這些醫簿上記錄的相關人等就會招致麻煩，甚至惹上殺身之禍。

很顯然，御藥局和御藥房是皇帝的專屬“藥劑科”。

東宮典藥局 皇太子私人醫院

東宮典藥局設局郎1人，局丞1人，內使10人。典藥局郎、局遠及內使負責皇太子的醫療保健。

安樂堂和月子房 宮廷女子醫院

皇后及嬪妃有病，多由太醫院醫官診視。后宮設安樂堂，專供后嬪養病；設有月子房，供宮內孕產用。后宮設醫官3人，醫士36人，還配有穩婆（接生婆）、乳婆、醫整數十人。

王府良醫所 王爺們的“保健醫”

良醫所設良醫正、良醫備1人，壽官數人，俱從文官，由太醫院推薦，吏部任命。良醫所是主管王府醫療保健的專門機構。名醫李時珍也曾出任王府良醫。

惠民藥局 各級地方醫院

明朝的惠民藥局分為中央與地方惠民藥局，是太醫院的下屬機構。惠民藥局主要職責是為平民診病賣藥，掌管貯備藥物、調制成藥等，軍民工匠貧病者均可在惠民藥局求醫問藥。遇疫病流行，惠民藥局有時也免費提供藥物。

史載，“洪武三年（1370年）置惠民藥局，府設提領，州縣設醫官。凡軍民之貧病者給予醫藥”，可見惠民藥局是專為貧病者所設的官辦醫療機構。由洪武初制定的惠民藥局規則，后來在地方上沒能完全執行，因此在永樂四年（1406年）明成祖“命禮部申明惠民藥局者今有實惠，勿徒有文具而已”的措辭，強調了惠民藥局“必有實惠”。

但總體來看，明朝的惠民藥局地位低下，中央惠民藥局有名無實，地方惠民藥局未能進入主流社會。許多藥局有名無實或有醫無藥，或局舍破敗。